Gdański Uniwersytet Medyczny, realizując projekt EuCanImage - „Europejska platforma badań radiologicznych integrująca dane kliniczne w oparciu o sztuczną inteligencję kolejnej generacji dla medycyny celowanej w onkologii (A European Cancer Image Platform Linked to Biological and Health Data for Next-Generation Artificial Intelligence and Precision Medicine in Oncology.)” poszukuje Menadżera / Analityka Danych.
Celem projektu EuCanImage jest budowa europejskiej, wieloośrodkowej, platformy będącej repozytorium onkologicznych badań obrazowych i powiązanych danych klinicznych wraz z niezbędnym oprogramowaniem, znacznie wzmacniającej potencjał zastosowań sztucznej inteligencji w onkologicznej diagnostyce obrazowej. Bliska współpraca klinicystów, specjalistów od radiomiki, biostatystyki, bioinformatyki, sztucznej inteligencji, prawników, etyków, przedstawicieli grup pacjentów oraz innych ekspertów w obrębie konsorcjum pozwoli na stworzenie systemu wspierania decyzji diagnostyczno-leczniczych w wybranych chorobach nowotworowych zgodnie z ideami spersonalizowanego podejścia do pacjenta i medycyny precyzyjnej.
DO ZADAŃ OSOBY ZATRUDNIONEJ NA TYM STANOWISKU BĘDZIE NALEŻAŁO:
1. Opracowanie baz danych, w tym:
- Identyfikacja pacjentów spełniających zadane kryteria, w oparciu o istniejący system komputerowy,
- Zbieranie i czyszczenie danych klinicznych,
- Identyfikacja i zbieranie powiązanych badań radiologicznych,
- Rozwiązywanie problemów związanych z brakami danych,
- Kontrola jakości danych,
- Anonimizacja danych zgodnie z międzynarodowymi standardami,
- Wprowadzanie danych do wewnętrznych i zewnętrznych repozytoriów zgodnie z dokumentacją projektową.
2. Analiza baz danych, w tym:
- Analiza bazodanowa pozyskanych zbiorów danych,
- Wizualizacja danych,
- Wizualizacja wyników zapytań i analiz,
- Opracowanie uzyskanych wyników i przedstawienie zespołowi badawczemu w zrozumiałej formie,
- Tworzenie okresowych kwerend i zestawień.
3. Ponadto:
- Przygotowywanie informacji merytorycznych niezbędnych w ramach projektu oraz stosownych prezentacji dotyczących analizowanych baz danych,
- Pomoc w przygotowaniu publikacji naukowych,
- Wsparcie w tworzeniu nowych projektów badawczych w zakresie sztucznej inteligencji i radiomiki w analizie obrazów medycznych,
- Współpraca z klinicystami w zakresie prowadzonych projektów,
- Udział w spotkaniach dotyczących projektu,
- Udział w szkoleniach niezbędnych do realizacji projektu.
OD KANDYDATÓW OCZEKUJEMY:
- Wykształcenie wyższe (preferowane kierunki ścisłe, takie jak matematyka, statystyka, fizyka medyczna, informatyka lub pokrewne),
- Dobra znajomość MS Excel, oraz obsługi plików CSV i JSON,
- Znajomość języka angielskiego co najmniej na poziomie B2 (projekt międzynarodowy w języku angielskim),
- Umiejętność planowania własnego czasu pracy zgodnie z założeniami harmonogramu projektu,
- Wcześniejsze doświadczenie w projektach biomedycznych, z analizą danych i uczenia maszynowego mile widziane,
- Średnio-zaawansowana znajomości języka programowania PYTHON,
- Atutem będzie znajomość jednego z języków programowania często używanych w obróbce danych biomedycznych (Python, R, Matlab), znajomość technik wielowymiarowej analizy danych, umiejętność prezentacji danych w dostępnym oprogramowaniu open source,
- Doświadczenie praktyczne i wiedza teoretyczna z zakresu algorytmów klasyfikacji/regresji/prognozowania i umiejętność przekazania sposobu ich działania odbiorcy nietechnicznemu mile widziane.
